元データを忠実にマークアップして保存しておけばいいだけだね。っていってもユーザ入力のデータで保存するのは改行ぐらいだろうから、l 要素に各行格納してつっこめばOKな気がする。必要なら文中の URI をマークしてもいいかもしれない。