Windows を再インストールして、

wsl --import-in-place Ubuntu D:\wsl\ubuntu\ext4.vhdx

みたいなことをしたら以上のようなエラーをいわれるようになってしまった……

ただ、管理者権限だと起動できる。該当する .vhdx ファイルのプロパティのセキュリティタブを見てみると変更権限などが一般ユーザになかったため追加したらうまくいった。